克拉克已经接受了自己是这个大都会(或世界)的英雄的事实，露易丝也成长为耀眼的调查记者，她将有抱负的摄影师吉米·奥尔森纳入自己的麾下。在这期间，克拉克和露易丝坠入爱河，共同分享冒险经历，一起打击坏人，偶尔也能发现一些秘密。

深夜，挥舞巨大钢筋袭击人类的亡灵“钢人七濑”。是单纯的都市传说，还是真正的亡灵？给予妖魔鬼怪们智慧的巫女——岩永琴子，与之正面抗衡。为了消灭由人类想象力创造的恐怖妖怪，为了对抗虚构，琴子设下了由虚构组成的重重机关。空前绝后的推理能否成功？

在梦之国格兰贝尔与机器一起生活的少年西奇，与100年未有的外来者：B立方主丽贝卡以及蓝猫哈比邂逅。他们立刻志趣相投，成为了朋友。这次小小的邂逅，将大幅度改写他今后的命运。梦想着前所未见的世界，少年、少女与蓝猫开始了一场无止境的冒险！

邪恶组织――侵略一切，毁灭一切。这个残忍而狡猾的组织，其智囊正是王的心腹，邪恶参谋。面对地面遭受侵略的危机，奋起迎战的是不幸的魔法少女・白夜。与她对峙的邪恶参谋・米拉竟对她一见钟情……魔法少女与邪恶为敌，已然成为过去。相爱（不）相杀的二人，究竟未来会如何――？

自前作中蕾哈尔背叛夜，并将其推落水中已经过去6年。在塔的20层，许多甄选人员因无法通过测试而贫困潦倒。甄选人员之一，屡次落榜的青年吉王男屡次被高利贷商人催收用于缴纳考试费用的借款，并终于在可能要签下贩卖自身器官的合同这一前提下，再次挑战20层的测试。在那里出现了一位拥有压倒性力量，把头发绑在后面随风飘舞的，名叫久·威傲来·格雷斯的男子。他是FUG的候补杀手，而FUG则是与统治塔的吉黑德和十大家族相敌对的犯罪组织（即所谓恐怖分子）。在测试中，高利贷商人兼催债人的公子普林斯、莲家千金梨花、人称「右臂恶魔」的大