星（安志杰 饰）生性嗜血残暴，冷酷无情。某日，觊觎皇位已久的他终于下手将皇帝杀死，不仅如此，还试图戕害公主莲（刘亦菲 饰）和她的弟弟昭（苏嘉航 饰）。无奈之下，手无寸铁的莲带着弟弟踏上了逃亡的旅途。

由“宙斯”领导的一个跨星球的神秘军事组织，利用DNA细胞变异技术，把强风（安志杰饰）的身体改造成超越人类的极限杀人武器“强化人”，以达到控制宇宙的目的。 强风不愿成为杀人武器，逃回地球并化身黑侠。但他必须在体内基因变异过程完成之前复原，否则性命不保。他尝试求助地球上知名的生物遗传学家，但与此同时，他们都遭到了“宙斯”旗下另一个终极“强化人”郎博士的追杀……

国际安全局的王尚恩（安志杰 饰）率万飞（周杰伦 饰）等部下远赴约旦，押送制造天花病毒变体的科学家肯纳，岂料王尚恩叛变将肯纳劫走，万飞头部受重伤，他同队中的心上人也在这次任务中身亡。三个月后，王尚恩等人研制的病毒造成一艘货船上的人们尽数死亡，而他此时准备贩卖疫苗谋取暴利；万飞在医院中被告知头部的子弹无法取出，神经受损导致他两周后会有生命危险，万母向其透露他有一个失散多年的哥哥。为了完成母亲心愿，万飞前往吉隆坡寻找哥哥万阳（谢霆锋 饰）。飞机上与万飞同行的简博士恰巧是王尚恩一伙准备用来替换肯纳的病毒专家，简博